Ο Ταξίαρχος Στέφανος Τσοτάκος, γεννήθηκε το 1971 στην Αθήνα. Εισήχθη το 1991 στη Στρατιωτική Σχολή Ευελπίδων, από την οποία αποφοίτησε το 1994 με τον βαθμό του Ανθυπολοχαγού Πεζικού.
Φοίτησε σε όλα τα προβλεπόμενα σχολεία του Όπλου του, στη Σχολή Διοίκησης και Επιτελών, στο NATO Operational Planning Course, στην Ανώτατη Διακλαδική Σχολή Πολέμου και στη Σχολή Εθνικής Άμυνας.
Κατά τη διάρκεια της σταδιοδρομίας του υπηρέτησε ως Δρίτης και Δκτης Λόχου σε Μονάδων Πεζικού της ΑΣΔΑΑΜ και της ΑΣΔΙΘ, στη Στρατιωτικής Σχολής Ευελπίδων, ως Υπασπιστής του κ. Αρχηγού του Γενικού Επιτελείου Στρατού, ενώ διατέλεσε Διοικητής του 536 Μ/Κ ΤΠ.
Έχει υπηρετήσει ως επιτελής Εθνικών Σχεδίων στο ΓΕΣ/Α3, επιτελής PLANS and POLICY στo NATO Supreme Allied Command Transformation στις ΗΠΑ. Επίσης, έχει υπηρετήσει ως Επιτελάρχης της 31 Μ/Κ ΤΑΞ, Διευθυντής της ΑΣΔΑΑΜ/A1 και της Διεύθυνσης Επιθεωρήσεων του ΓΕΣ, Επιτελάρχης της ΧΙΙ Μ/Κ ΜΠ, καθώς και ως Τμηματάρχης του Τμήματος Διεθνών Σχεδίων του ΓΕΕΘΑ/Α2.
Ως Ανώτατος Αξιωματικός (Ταξίαρχος) προήχθη το έτος 2025, αναλαμβάνοντας τη Διοίκηση της 31 Μ/Κ ΤΑΞΙΑΡΧΙΑΣ «ΚΑΜΙΑ». Το 2026 κατόπιν απόφασης του ΑΣΣ στις ανέλαβε τα καθήκοντα του Δκτη της Σχολής Πεζικού.
Στον Ταξίαρχο Στέφανο Τσοτάκο έχει απονεμηθεί το σύνολο των προβλεπόμενων Παρασήμων, Μεταλλίων και Διαμνημονεύσεων.
Ο Ταξίαρχος Στέφανος Τσοτάκος είναι κάτοχος Μεταπτυχιακού Τίτλου στην Εφαρμοσμένη Στρατηγική και Διεθνή Ασφάλεια του Plymouth University, καθώς και υποψήφιος Διδάκτωρ στο Τμήμα Διεθνών Σπουδών της Παντείου. Επιπλέον είναι γνώστης της Αγγλικής και της Γερμανικής Γλώσσας.
Είναι έγγαμος και έχει 4 τέκνα.